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人和小鼠胰腺的單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜
行業(yè)新聞 2018-12-19

  盡管哺乳動物胰腺的功能取決于不同細胞類型的復雜相互作用,但基因表達譜主要用大量混合物描述。從研究人員在這里以色列理工學院實施了基于液滴的單細胞RNA-seq方法,以確定來自四個人供體和兩個小鼠品系的超過12,000個個體胰腺細胞的轉(zhuǎn)錄組。

人和小鼠胰腺的單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜

  細胞可分為15個簇,這些簇與先前表征的細胞類型相匹配:所有內(nèi)分泌細胞類型,包括稀有ε細胞; 外分泌細胞類型; 血管細胞; 施萬細胞; 靜止和活化的星狀細胞; 和四種類型的免疫細胞。

  研究人員檢測了具有不同表達譜的導管細胞亞群,并用免疫組織化學染色法驗證了它們的存在。此外,在人類β細胞中,他們檢測到與功能成熟和ER應激水平相關(guān)的基因調(diào)控的異質(zhì)性。

人和小鼠胰腺的單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜

  最后,他們使用單細胞數(shù)據(jù)對大量基因表達樣本進行去卷積,以檢測與疾病相關(guān)的差異表達。該數(shù)據(jù)集為發(fā)現(xiàn)新的細胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子,信號傳導受體和醫(yī)學相關(guān)基因提供了資源。

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